La struttura della Gastroenterologia ed endoscopia digestiva dell'ospedale San Giuseppe di Empoli si occupa, in regime di ricovero o ambulatoriale, della diagnosi e della cura delle principali patologie epato-gastroenterologiche.
E’ presidio di rete regionale per la diagnosi e cura della Malattia celiaca e di diagnosi e/o controllo di alcune patologie rare epato-gastroenterologiche (Acalasia Esofagea, Gastroenterite Eosinofila, Colangite sclerosante Primitiva, Emocromatosi Ereditaria, Malattia di Wilson, Carenza Congenita di Alfa 1-antitripsina).
E’ presidio della rete regionale del trapianto di fegato per il percorso di accesso al trapianto e follow-up dei pazienti trapiantati.